运行人数分为垂直流动实验室用低温操作台和水平流动实验室用低温操作台；超净工作台从运行人数上分为单工和双工；超净工作台从结构上分为常规型、新型型和自循环型(仅垂直型)。

超净工作台和水平流动超净工作台，垂直工作台由于风机在顶部，噪音较大，但风是用来垂直吹的，以保证身体健康；水平流动工作台噪音较小，风向外因此多用于电子行业，对健康影响不大。按作业结构可分为单边作业和双边作业，按用途可分为普通超净台和生物(医药)超净台。

按数量划分:单个实验室用低温操作台，双人实验室用低温操作台；

根据使用面的数量分类:分为单侧操作和双侧操作；需要注意的是，单面和双面只适用于垂直超净台，而水平超净台没有单面和双面。